Services communs

Responsable :
Myriam MOHAMED



 

 

 

 

Missions 


 

Le plateau EpHISTain, est dédié au soutien technique des équipes de l’Unité « Épigénétique et Destin cellulaire » dans les domaines de l’histologie et de la cytologie pour accompagner le travail de recherche des équipes dans l’élucidation du rôle, des mécanismes de mise en place, et de maintien de modifications épigénétiques qui déterminent la plasticité et le destin cellulaire. 

Ce service vise à employer diverses techniques d’histologies, d’histochimie, d’immunohistochimie, d’immunofluorescence, d’hybridation in situ (HIS), de « Fluorescence in situ hybridization (FISH) et de cytologie, pour la production et le marquage de coupes de tissus biologiques (animal ou organoïde), ainsi que le marquage de cellules.

Il s’oriente également dans un futur proche vers la mise en œuvre de techniques cytogénétiques conventionnelle et moléculaire (Caryotype et FISH) pour contrôler en routine la qualité des cellules avant et après édition de l’(épi)génome.

 

Prestations


  1. Soutien technique ou prise en charge des échantillons (frais, fixés, congelés) pour la production de coupes de tissus biologiques. La technique choisie est fonction des problématiques techniques et scientifiques des équipes, ainsi que des traitements nécessaires pour y répondre :
  • Dissection, préparation et fixation des tissus (dont embryonnaires) 
  • Inclusion des tissus (OCT et agarose)
  • Coupe de tissus (vibratome ou cryostat), sur lames ou en coupes flottantes

  1. Traitement des coupes de tissus biologiques. Le choix du traitement dépend du type de tissu, des problématiques techniques et de la question biologique à laquelle doit répondre l’expérimentation :
  • Explorer la morphologie des tissus ou l’organisation de structures d’intérêts sur coupes afin de mettre en évidence d’éventuels modifications ou défauts structurels
    • Coloration histochimique sur coupes de tissus biologiques (ex : crésyl violet)
    • Hybridation In Situ (HIS) sur coupes au cryostat, flottantes ou sur lames, pour le marquage de structures spécifiques (ex : marqueurs de couches corticales)

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  • Caractériser le profil d’expression de gènes d’intérêts (expression ou non et localisation cellulaire) en ciblant l’ARNs ou les protéines
    • Hybridation In Situ (HIS) sur coupes au cryostat, flottantes ou sur lames
    • Immunohistochimie et Immunofluorescence
    • FISH (DNA et RNA)

 

  1. Assurer une démarche qualité pour le contrôle des cellules souches avant et après édition de l’(épi)génome (prestation en cours de développement)
  • Landmarks génomiques et transcriptionnels de comportement cellulaire « normal » (ex : le chromosome X, les séquences satellites…)
    • DNA FISH (Fluorescent in situ hybridization)
    • RNA FISH
  • Caryotypage de ces cellules souches
    • Étalement de chromosome
    • Chromosome painting
    • Spectral karyotyping (SKY) FISH

 

  1. Imagerie contrôle qualité des résultats (sur le plateau EPI2, EDC)

 

  1. Accompagner
  • Optimiser et standardiser les protocoles de marquage sur tissus et cellules pour une homogénéité et une reproductibilité qui permettent de croiser les données des équipes.
  • Adapter et mettre au point les protocoles de marquage sur tissus ou cellules selon les problématiques spécifiques des équipes, en apportant une expertise technique
  • Former les membres d’équipes aux techniques de coupes et de marquages selon les besoins, en partageant les protocoles et les savoir-faires.

 

Membres et comité de pilotage


Pour toute demande de renseignement ou pour soumettre un projet, vous pouvez contacter

Myriam Mohamed – TCS CNRS 

Équipe : Service commun

myriame.mohamed@u-paris.fr

 

Tout nouveau projet est soumis pour validation au comité de pilotage qui soutient scientifiquement le plateau

Véronique Dubreuil – MCF U-PARIS

Equipe : Interface développement & environnement 

 

Claire Francastel – Chef d’équipe / DR2 INSERM 

Equipe : Methylation de l’ADN et ARNs non-codants en physiopathologie

 

Céline Morey – CR1 Inserm

Equipe : ARNs non-codants, Différenciation et Développement